Le préfet de La Réunion assume le rôle de Délégué du Gouvernement pour l’Action de l’Etat en Mer dans la Zone Maritime du Sud de l’Océan Indien.
Il est assisté par l'officier de marine exerçant les fonctions de Commandant de Zone Maritime du Sud de l’Océan Indien, qui coordonne l'action des administrations et la mise en œuvre de leurs moyens, pour la sauvegarde des intérêts nationaux en mer.

Le CZM bénéficie du concours des services et administrations de l'État de la ZMSOI qui mettent à sa disposition les moyens et informations d'intérêt général dont ils disposent, l'informent si nécessaire de la gestion et de la mise en œuvre de ces moyens dans le cadre de leurs missions propres, et lui rendent compte de l'exécution des tâches et des difficultés rencontrées.

Le CZM est chargé :
- de la surveillance du milieu marin, concurremment avec les administrations de l'Etat chargées de responsabilités particulières ;
- de l'information des autorités exerçant des responsabilités de défense et, s'il y a lieu, du soutien opérationnel ou logistique des opérations conduites par ces autorités ;
- de la surveillance et de la signalisation des mouvements des forces navales et des navires français et étrangers, de la police du pavillon et, lorsqu'il est mis en œuvre, du contrôle naval ;
- de la diffusion d'informations nécessaires à la navigation, conformément aux instructions en vigueur ;
- de l'organisation et de la conduite des opérations de lutte anti-pollution en mer placées sous la direction du préfet DGAEM ;
- de la préparation, la veille juridique et la diffusion des textes réglementaires concernant l’action de l’Etat en mer, en relation avec les administrations concernées.

De plus, il conseille le DGAEM sur :
- la programmation de l'emploi des moyens ;
- la planification des opérations ;
- l’exploitation du renseignement et de l'information opérationnelle.

Enfin, il rend compte au préfet DGAEM de l’exécution des missions relevant de l'AEM.

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